Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms