Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf3Q8R3J4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mterf3Q8R3J4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms