Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms