Protein–RNA interactions for Protein: Q8K441

Abca6, ATP-binding cassette sub-family A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca6Q8K441 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abca6Q8K441 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abca6Q8K441 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abca6Q8K441 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms