Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms