Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lrrtm1Q8K377 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lrrtm1Q8K377 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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