Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms