Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms