Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcho1Q8K285 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms