Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FgbQ8K0E8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FgbQ8K0E8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FgbQ8K0E8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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FgbQ8K0E8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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FgbQ8K0E8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms