Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gfm1Q8K0D5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms