Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms