Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf17Q8CFA7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms