Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc28bQ8CEG5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms