Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8C708 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8C708 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8C708 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8C708 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8C708 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8C708 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8C708 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8C708 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8C708 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms