Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FarsaQ8C0C7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FarsaQ8C0C7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FarsaQ8C0C7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FarsaQ8C0C7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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