Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms