Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Usp38Q8BW70 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms