Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT42

Smim5, Small integral membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim5Q8BT42 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smim5Q8BT42 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim5Q8BT42 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms