Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT14

Cnot4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot4Q8BT14 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot4Q8BT14 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms