Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp54Q8BL06 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms