Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms