Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcal1Q8BJL0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms