Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slfnl1Q8BHW9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfnl1Q8BHW9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfnl1Q8BHW9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms