Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3bQ8BHK2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3bQ8BHK2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3bQ8BHK2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3bQ8BHK2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3bQ8BHK2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3bQ8BHK2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3bQ8BHK2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3bQ8BHK2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms