Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ3

Dcaf12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf12Q8BGZ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dcaf12Q8BGZ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms