Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe23Q8BGW3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.8 ms