Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms