Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Vipas39Q8BGQ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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