Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms