Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpped1Q8BFS6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpped1Q8BFS6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpped1Q8BFS6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpped1Q8BFS6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpped1Q8BFS6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpped1Q8BFS6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpped1Q8BFS6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpped1Q8BFS6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms