Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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