Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms