Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Abcc12Q80WJ6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Abcc12Q80WJ6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Abcc12Q80WJ6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcc12Q80WJ6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms