Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm2Q80W85 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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Npm2Q80W85 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
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Npm2Q80W85 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm2Q80W85 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm2Q80W85 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms