Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc29Q80VM3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc29Q80VM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc29Q80VM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc29Q80VM3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ttc29Q80VM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ttc29Q80VM3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ttc29Q80VM3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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