Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms