Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims3Q80U57 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims3Q80U57 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims3Q80U57 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms