Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arhgef17Q80U35 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms