Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul9Q80TT8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms