Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT15

Galnt17, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt17Q7TT15 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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Galnt17Q7TT15 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Galnt17Q7TT15 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Galnt17Q7TT15 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Galnt17Q7TT15 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Galnt17Q7TT15 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Galnt17Q7TT15 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Galnt17Q7TT15 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Galnt17Q7TT15 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Galnt17Q7TT15 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Galnt17Q7TT15 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Galnt17Q7TT15 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Galnt17Q7TT15 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms