Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2q1Q7TSS2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2q1Q7TSS2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms