Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tnfsf18Q7TS55 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tnfsf18Q7TS55 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tnfsf18Q7TS55 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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