Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LnpkQ7TQ95 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms