Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms