Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HhipQ7TN16 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HhipQ7TN16 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms