Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Shq1Q7TMX5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms