Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms