Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27Q6ZWU9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms