Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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